Veel van de documentaires van Jaap van Hoewijk gaan al vanaf het begin van zijn carriere over onopgeloste zaken en sterfelijkheid. Voor zijn debuutfilm Procedure 769 (1995) sprak hij getuigen van de executie van moordenaar Robert Alton Harris.
In de documentaire Familiegeheim (2001) onderzocht hij de doodsoorzaak van zijn eigen vader, van wie hij drieëntwintig jaar lang had gedacht dat hij was verongelukt. Killing Time (2013) werkt toe naar de uitvoering van een executie in Texas. En zijn laatste film, Piet is weg (2017), gaat over de onopgeloste verdwijning van Piet Beentjes, die op 26 april 1987 voor het laatst gezien werd toen hij op de pont naar Texel stapte.